「タワー オブ アイオン」の世界は各地域ひとつひとつが連結して一つの世界を構成している。各地域の中では徒歩や飛行といった交通手段を用いて移動することができ、飛行移動士を通して近い地域間で飛行移動することができる。また他の地域に移動するためには村や要塞内に配置されている空間移動士を利用して移動しなければならない。
活性化した時空の亀裂を利用すれば天族は魔族地域に、魔族は天族地域に一気に移動をすることができる。時空の亀裂を利用して遂行しなければならない特殊なクエストも存在をする。当然、敵陣地に侵入をした後にはPvPが可能だ。
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